In de haven van Rotterdam komt veel slib terecht dat wordt aangevoerd vanuit de rivier de Rijn en de zijrivieren. Het Havenbedrijf Rotterdam en Rijkswaterstaat (RWS) moeten hierdoor de vaarwegen en havens voortdurend op diepte houden door te baggeren. Een substantieel deel van de vrijkomende baggerspecie is verontreinigd en kan daarom niet direct worden hergebruikt of worden teruggebracht in het watersysteem. Het vervuilde slib werd voorheen in de Noordzee gestort. Daar dit een onhoudbare situatie bleek, is in het begin van de jaren 1980 door het Havenbedrijf en RWS besloten een depot te bouwen waarin dit slib gestort kan worden.
De Slufter is aangelegd en gefinancierd door de gemeente Rotterdam en RWS. Tussen het depot op de Maasvlakte en de kust van Voorne is tevens een slufter gecreëerd, een ondiep gebied waar eb en vloed vrij spel hebben. Aan de zuid-westpunt van het terrein werd voor recreanten het Slufterstrand aangelegd.